《電子技術(shù)應(yīng)用》
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一種基于FP-growth的并行SON算法的實(shí)現(xiàn)
來(lái)源:微型機(jī)與應(yīng)用2014年第8期
郭進(jìn)偉1,2,皮建勇1,2
(1.貴州大學(xué) 計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,貴州 貴陽(yáng)550025;2.貴州大學(xué) 云計(jì)算與物聯(lián)網(wǎng)研究中心,
摘要: 單節(jié)點(diǎn)運(yùn)行的傳統(tǒng)SON算法能夠有效降低CPU和I/O負(fù)載,而且算法僅需要對(duì)整個(gè)事務(wù)數(shù)據(jù)集掃描兩次。但是在算法執(zhí)行的階段一中發(fā)現(xiàn)局部頻繁項(xiàng)集時(shí)采用的Apriori算法仍然需要對(duì)每個(gè)分區(qū)進(jìn)行多次掃描。在深入研究SON算法的基礎(chǔ)上,根據(jù)MapReduce編程模型提出了基于FP-growth的SON算法的并行化實(shí)現(xiàn)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,基于FP-growth的并行SON算法不僅降低了傳統(tǒng)SON算法的運(yùn)行時(shí)間,并且隨著分區(qū)數(shù)目的增加還能獲取比較好的加速比。
Abstract:
Key words :

摘  要: 單節(jié)點(diǎn)運(yùn)行的傳統(tǒng)SON算法能夠有效降低CPU和I/O負(fù)載,而且算法僅需要對(duì)整個(gè)事務(wù)數(shù)據(jù)集掃描兩次。但是在算法執(zhí)行的階段一中發(fā)現(xiàn)局部頻繁項(xiàng)集時(shí)采用的Apriori算法仍然需要對(duì)每個(gè)分區(qū)進(jìn)行多次掃描。在深入研究SON算法的基礎(chǔ)上,根據(jù)MapReduce編程模型提出了基于FP-growth的SON算法的并行化實(shí)現(xiàn)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,基于FP-growth的并行SON算法不僅降低了傳統(tǒng)SON算法的運(yùn)行時(shí)間,并且隨著分區(qū)數(shù)目的增加還能獲取比較好的加速比。
關(guān)鍵詞: FP-growth;SON 算法;MapReduce;數(shù)據(jù)挖掘

    信息技術(shù)的高速發(fā)展使得各行各業(yè)累積了海量數(shù)據(jù),如何從中提取有用的信息已經(jīng)成為了數(shù)據(jù)挖掘所面臨的巨大挑戰(zhàn)。頻繁項(xiàng)集是數(shù)據(jù)挖掘中一個(gè)非常重要的概念,Apriori算法[1]和FP-growth算法[2]是挖掘頻繁項(xiàng)集最為著名的算法,但其串行計(jì)算的復(fù)雜度較高。SON算法[3]為并行化發(fā)現(xiàn)頻繁項(xiàng)集提供了解決思路。
    谷歌于2004年提出了MapReduce編程模型[4],為并行處理和分析大規(guī)模的數(shù)據(jù)提供了重要的參考。根據(jù)MapReduce編程模型涌現(xiàn)出了眾多的開(kāi)源項(xiàng)目,其中Apache基金會(huì)下的Hadoop[5]是其中比較有代表性的分布式并行編程框架。近幾年隨著大數(shù)據(jù)的興起,MapReduce編程模型的研究[6]以及基于MapReduce的數(shù)據(jù)挖掘算法的實(shí)現(xiàn)[7]也愈加火熱。
1 相關(guān)概念
1.1 FP-growth算法簡(jiǎn)介

    FP-growth算法是Han Jiawei等人于2000年提出的發(fā)現(xiàn)頻繁項(xiàng)集的算法,該算法采用分治策略將一個(gè)問(wèn)題分解為較小的子問(wèn)題,從而發(fā)現(xiàn)以某個(gè)特定后綴結(jié)尾的所有頻繁項(xiàng)集。該算法使用了一種稱(chēng)之為頻繁模式樹(shù)FP-tree(Frequent Pattern Tree)的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),F(xiàn)P-tree是一種特殊的前綴樹(shù),由頻繁項(xiàng)頭表和項(xiàng)前綴樹(shù)構(gòu)成。
    FP-growth算法發(fā)現(xiàn)頻繁項(xiàng)集的基本思想是:根據(jù)FP-tree構(gòu)造每個(gè)頻繁項(xiàng)的條件FP-tree,每個(gè)頻繁項(xiàng)都是一個(gè)前綴;每個(gè)前綴和其條件FP-tree的每一項(xiàng)合并生成一個(gè)新的前綴,根據(jù)此前綴繼續(xù)生成條件FP-tree,直到生成的條件FP-tree為空;每一個(gè)前綴都是頻繁的,即算法所得到的所有的前綴即為最終的頻繁項(xiàng)集。
    相比于A(yíng)priori算法,FP-growth算法有如下優(yōu)點(diǎn):(1)將較大的數(shù)據(jù)庫(kù)壓縮成了較小的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)保存在內(nèi)存中,從而避免了反復(fù)掃描數(shù)據(jù)庫(kù),降低了掃描開(kāi)銷(xiāo);(2)基于FP-tree的挖掘采用遞歸的方式搜索較短的模式并將其逐次連接起來(lái),從而避免生成大量的候選項(xiàng)集;(3)將原本的挖掘任務(wù)劃分成一組在有限的條件數(shù)據(jù)庫(kù)中挖掘特定的頻繁模式的任務(wù),從而降低了搜索空間。
1.2 SON算法簡(jiǎn)介
    Apriori算法通過(guò)迭代的方式來(lái)挖掘出所有的頻繁項(xiàng)集,即候選(k+1)-項(xiàng)集的產(chǎn)生依賴(lài)于頻繁k-項(xiàng)集,然后通過(guò)掃描事物數(shù)據(jù)集來(lái)計(jì)算出每一個(gè)候選(k+1)-項(xiàng)集支持度計(jì)數(shù),進(jìn)而判斷得到頻繁(k+1)-項(xiàng)集,因此該算法需要對(duì)事務(wù)數(shù)據(jù)集進(jìn)行多次掃描。如果找到這樣一種方法,通過(guò)該方法得到的候選項(xiàng)集包含了該事務(wù)數(shù)據(jù)集中所有的頻繁項(xiàng)集,那么只需要對(duì)事物數(shù)據(jù)集掃描一遍即可找出所有的頻繁項(xiàng)集。
    以上為分區(qū)算法的核心思想。分區(qū)算法需要對(duì)事物數(shù)據(jù)集進(jìn)行兩遍掃描,第一遍掃描找出候選項(xiàng)集,此候選項(xiàng)集包含所有的頻繁項(xiàng)集。第二遍掃描對(duì)所有的候選項(xiàng)集新型計(jì)數(shù),其中大于最小支持度計(jì)數(shù)的候選項(xiàng)集即為頻繁項(xiàng)集。
    根據(jù)分區(qū)算法兩遍掃描的思想,算法的執(zhí)行分為兩個(gè)階段。在第一個(gè)階段,算法把事物數(shù)據(jù)集劃分為數(shù)個(gè)互不相交的分區(qū),然后分別為每個(gè)分區(qū)計(jì)算出本分區(qū)的頻繁項(xiàng)集(稱(chēng)之為局部頻繁項(xiàng)集,此項(xiàng)集是潛在的整個(gè)事務(wù)數(shù)據(jù)集的頻繁項(xiàng)集),最后把所有分區(qū)的頻繁項(xiàng)集匯聚到一起就得到了整個(gè)事務(wù)數(shù)據(jù)集的候選項(xiàng)集(稱(chēng)之為全局候選項(xiàng)集)。在第二個(gè)階段,為上一個(gè)階段得到的全局候選項(xiàng)集進(jìn)行計(jì)數(shù),從而得到候選項(xiàng)集的支持度計(jì)數(shù),其中大于最小支持度計(jì)數(shù)的候選項(xiàng)集即為全局頻繁項(xiàng)集。以下為SON算法的偽代碼,表1為偽代碼中所用的符號(hào)定義說(shuō)明。

    偽代碼中首先將事務(wù)數(shù)據(jù)集D劃分為n個(gè)分區(qū),階段1分別對(duì)每一個(gè)分區(qū)pi通過(guò)gen_large_itemsets方法計(jì)算其局部頻繁項(xiàng)集L′,該方法采用的是Apriori算法。在合并階段,算法將每個(gè)分區(qū)局部頻繁項(xiàng)集合并成一個(gè)全局候選項(xiàng)集CG。在階段2中,算法計(jì)算每個(gè)全局候選項(xiàng)集的支持度計(jì)數(shù),其中大于最小支持度計(jì)數(shù)minSup的為最終的頻繁項(xiàng)集LG。
2 基于FP-growth的SON算法的并行化實(shí)現(xiàn)
    從SON算法的描述中可以看出,在算法第一階段中需要計(jì)算出局部頻繁項(xiàng)集,原始的SON算法采用Apriori算法來(lái)計(jì)算每個(gè)分區(qū)的頻繁項(xiàng)集,即同樣需要對(duì)每個(gè)分區(qū)掃描多次才能得到局部頻繁項(xiàng)集,所以SON算法是宏觀(guān)上對(duì)整個(gè)事務(wù)數(shù)據(jù)集掃描兩次,而從局部上來(lái)看仍然需要對(duì)每個(gè)分區(qū)分別掃描多次。本節(jié)提出的算法實(shí)現(xiàn)基于FP-growth,這將有效減少對(duì)分區(qū)的掃描次數(shù)。
    SON算法非常適合于并行計(jì)算環(huán)境,SON算法中的每一個(gè)分區(qū)都可以并行地處理。用MapReduce編程模型對(duì)基于FP-growth的SON算法進(jìn)行并行化實(shí)現(xiàn)。算法的實(shí)現(xiàn)需要兩輪迭代,第一輪MapReduce迭代計(jì)算出每一個(gè)分區(qū)的局部頻繁項(xiàng)集并由此生成全局候選項(xiàng)集。第二輪MapReduce迭代計(jì)算出每一個(gè)全局候選項(xiàng)集的支持度計(jì)數(shù),并根據(jù)支持度計(jì)數(shù)來(lái)判斷是否為頻繁項(xiàng)集。
2.1 第一輪MapReduce迭代
    在Map階段,每個(gè)Map任務(wù)完成從事務(wù)數(shù)據(jù)集的某一個(gè)分區(qū)中讀取到的事務(wù),并將該分區(qū)中所有的事務(wù)存儲(chǔ)在本地內(nèi)存中,然后利用FP-growth算法算出本分區(qū)的局部頻繁項(xiàng)集,最后輸出的是一個(gè)鍵值對(duì)<F,1>(其中F是本分區(qū)的一個(gè)局部頻繁項(xiàng)集,1與鍵沒(méi)有任何關(guān)聯(lián))。
    class FirstMapper {
       List tSet; //事務(wù)數(shù)據(jù)集
       Map localFI; //局部頻繁項(xiàng)集
       map(key, value) {
        //將value封裝為事務(wù)
        t = genTransaction(value);
        //將事務(wù)添加到事務(wù)數(shù)據(jù)集中
        tSet.add(transaction);
       }
       cleanup() {
        //用FP-growth算法計(jì)算得到局部頻繁項(xiàng)集
        localFI = genFrequentItemsets(transaction);
        //將局部頻繁項(xiàng)集輸出
        for(i = 1; (fis = localFI.get(i)) != null; i++)
           for(f : fis)
            write(f, 1);
       }
    }
    在Reduce階段,每個(gè)Reduce任務(wù)會(huì)處理一組局部頻繁項(xiàng)集,上個(gè)階段所有的Map任務(wù)輸出的相同的局部頻繁項(xiàng)集會(huì)集中到同一個(gè)Reduce任務(wù)上進(jìn)行處理,Reduce的任務(wù)就是將相同的局部頻繁項(xiàng)集輸出一次即可,最后的輸出結(jié)果即為全局的候選項(xiàng)集。

 


    class FirstReducer {
       reduce(key, values) {
        write(key, null);
       }
    }
2.2 第二輪MapReduce迭代
    在Map階段,每個(gè)Map任務(wù)仍然處理事務(wù)數(shù)據(jù)集上的一個(gè)分區(qū),在Map任務(wù)開(kāi)始前,把上一個(gè)MapReduce迭代產(chǎn)生的全局候選項(xiàng)集放入本地內(nèi)存中,Map任務(wù)開(kāi)始后每讀入一個(gè)事務(wù),找尋全局候選項(xiàng)集中哪些候選項(xiàng)集為此事務(wù)的子集,如果某候選項(xiàng)集為此事務(wù)子集,即輸出<F,1>(其中F為此候選項(xiàng)集,1代表為此事務(wù)的子集),便于在下一階段計(jì)算此候選項(xiàng)集的支持度計(jì)數(shù)。
    class SecondMapper {
       List cI; //全局候選項(xiàng)集
       setup() {
        //初始化全局候選項(xiàng)集
        cI = getCandidateItemsets();
       }
       map(key, value) {
        t = genTransaction(value);
        //若候選項(xiàng)存在于某事務(wù)中就進(jìn)行輸出
        for(f : cI)
           if(t.contain(f))
            write(f, 1);
       }
    }
    在Reduce階段,每個(gè)Reduce任務(wù)處理一組全局候選項(xiàng)集,上個(gè)階段所有的Map任務(wù)輸出的相同的候選項(xiàng)集會(huì)集中到同一個(gè)Reduce任務(wù)上進(jìn)行處理,計(jì)算全局候選項(xiàng)集的支持度計(jì)數(shù),根據(jù)其支持度計(jì)數(shù)即可判斷該項(xiàng)集是否為頻繁項(xiàng)集,Reduce任務(wù)會(huì)將得到的全局頻繁項(xiàng)集進(jìn)行輸出。
    class SecondReducer {
       reduce(key, values) {
        sum = 0;
        for(val : values)
        sum += val.get();
        //若候選項(xiàng)大于最小支持度就輸出
        if(sum >= minsup)
        write(key, null);
       }
    }
3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與實(shí)驗(yàn)分析
3.1 實(shí)驗(yàn)環(huán)境

    整個(gè)實(shí)驗(yàn)在Hadoop平臺(tái)下完成,平臺(tái)采用了Hadoop的1.0.4穩(wěn)定版本。硬件設(shè)備為4臺(tái)x86架構(gòu)的PC,主設(shè)備節(jié)點(diǎn)采用Intel志強(qiáng)四核處理器,內(nèi)存為2 GB;從設(shè)備節(jié)點(diǎn)采用了AMD四核處理器,主頻為2.7 GHz,內(nèi)存為2 GB。
3.2 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)集
    實(shí)驗(yàn)采用accidents[8]作為實(shí)驗(yàn)事務(wù)數(shù)據(jù)集,該數(shù)據(jù)集包含1991年~2000年Flanders地區(qū)的交通事故記錄。該數(shù)據(jù)集的大小為34 678 KB,共340 184條事務(wù),有572個(gè)不同的項(xiàng),平均每條事務(wù)包含45個(gè)項(xiàng)。
3.3 實(shí)驗(yàn)分析
    為了對(duì)基于A(yíng)priori的并行SON算法和基于FP-growth的并行SON算法進(jìn)行比較,首先用MapReduce模型分別實(shí)現(xiàn)兩個(gè)算法。發(fā)現(xiàn)兩個(gè)算法僅在階段1的局部頻繁項(xiàng)集處有異,在階段2沒(méi)有任何差別,所以實(shí)驗(yàn)僅對(duì)兩個(gè)算法的階段1的運(yùn)行進(jìn)行比較。兩個(gè)算法分別在同等的集群條件和同樣的數(shù)據(jù)集下運(yùn)行。由于分布式環(huán)境下的實(shí)驗(yàn)結(jié)果具有一定的顛簸性,所有實(shí)驗(yàn)的最終結(jié)果均為多次實(shí)驗(yàn)后取得的合理值。
    圖1為accidents數(shù)據(jù)集在保持不變和劃分為2塊、4塊、8塊的情況下,兩種算法分別在第一輪迭代時(shí)消耗的總時(shí)間。從圖1可以看出,在算法采用相同的分區(qū)數(shù)目時(shí),基于FP-growth的并行SON算法比基于A(yíng)priori的并行SON算法運(yùn)行時(shí)間明顯減少。隨著數(shù)據(jù)集劃分的分區(qū)數(shù)目的增加,兩種算法運(yùn)行的總時(shí)間將明顯減少。

    圖2顯示了隨著accidents數(shù)據(jù)集劃分塊數(shù)的增加,基于FP-growth的并行SON算法的運(yùn)行能夠得到接近線(xiàn)性的加速比。

    本文分析了傳統(tǒng)的SON算法,指出了SON算法雖然從宏觀(guān)上對(duì)事務(wù)數(shù)據(jù)集掃描了兩次,但是發(fā)現(xiàn)在局部頻繁項(xiàng)集時(shí)采用的Apriori算法仍然需要對(duì)每個(gè)分區(qū)掃描多次。根據(jù)MapReduce編程模型,本文提出的基于FP-growth的并行SON算法的實(shí)現(xiàn),不僅減少了SON算法在階段1中的運(yùn)行時(shí)間,并且算法運(yùn)行在Hadoop集群上,為處理海量數(shù)據(jù)提供了可能。雖然本文提出的算法的實(shí)現(xiàn)從某種程度上可以看作是FP-growth算法的并行化實(shí)現(xiàn),但是每個(gè)分區(qū)生成的FP-tree都是獨(dú)立的,互相之間沒(méi)有聯(lián)系,這導(dǎo)致了隨著分區(qū)數(shù)目的增加使階段1生成的全局頻繁項(xiàng)集也會(huì)增加。因此,如何利用MapReduce實(shí)現(xiàn)FP-growth的完全并行化實(shí)現(xiàn)將在后續(xù)工作中進(jìn)一步研究。
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