美國(guó)芝加哥—RSNA—2018 年 11 月 28 日—基于深度學(xué)習(xí)的注釋和分割可以大幅加快模型開發(fā)和醫(yī)學(xué)影像分析的速度。然而,從零開始開發(fā)高性能且精確的深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)非常具有挑戰(zhàn)性,而且很耗費(fèi)時(shí)間。所需數(shù)據(jù)集的成本和質(zhì)量往往是開發(fā)者要面對(duì)的兩大主要障礙。為幫助加快醫(yī)學(xué)影像領(lǐng)域的創(chuàng)新,NVIDIA 宣布推出適用于醫(yī)學(xué)影像的遷移學(xué)習(xí)工具包和 AI 輔助注釋 SDK。
NVIDIA 遷移學(xué)習(xí)工具包
通過 NVIDIA 遷移學(xué)習(xí)工具包 (TLT),醫(yī)學(xué)影像領(lǐng)域的深度學(xué)習(xí)應(yīng)用程序開發(fā)者可以利用NVIDIA 預(yù)訓(xùn)練模型,展開簡(jiǎn)單易用的訓(xùn)練工作流程,進(jìn)而利用自己的數(shù)據(jù)集微調(diào)并重新訓(xùn)練模型。
TLT 是一個(gè) Python 軟件包,其中每個(gè)模型都在 NVIDIA Pascal、Volta 和 Turing GPU 上進(jìn)行優(yōu)化和訓(xùn)練,以達(dá)到更高精確度。
在 2018 年 MICCAI 上,NVIDIA 憑借使用自動(dòng)編碼器正則化方法進(jìn)行的 3D 核磁共振成像(MRI) 腦部腫瘤分割,獲得了 BrATS 挑戰(zhàn)賽第一名。作為醫(yī)學(xué)影像軟件 TLT 的一部分,NVIDIA 在首個(gè)公開發(fā)布版本中提供此預(yù)訓(xùn)練模型。對(duì)多模態(tài) MR 數(shù)據(jù)和 3-D 胰腺進(jìn)行 3-D 腦部腫瘤分割以及對(duì)門靜脈期 CT 數(shù)據(jù)進(jìn)行腫瘤分割是在公共數(shù)據(jù)集上訓(xùn)練的部分模型,這些數(shù)據(jù)集可以在工具包中輕松獲取。
使用 NVIDIA 遷移學(xué)習(xí)工具包,開發(fā)者可以加快部署并減少構(gòu)建應(yīng)用程序所需的計(jì)算資源。利用此工具包,研究人員還可以將預(yù)訓(xùn)練模型擴(kuò)展到自己的工作中。通過簡(jiǎn)單易用的 API,開發(fā)者可以快速地調(diào)整并使用此技術(shù)。
使用 TLT 工作流程的模型也可以輕松部署至 Clara 平臺(tái)中以進(jìn)行推理。
TLT 將可用于 NVIDIA Tesla 和 DGX 產(chǎn)品。
NVIDIA AI 輔助注釋
當(dāng)涉及治療和診斷時(shí),放射科醫(yī)生最終需要花費(fèi)數(shù)小時(shí)仔細(xì)檢查一張患者的 3D 圖像。這是一個(gè)枯燥乏味的過程,放射科醫(yī)生必須逐個(gè)切片查看 CT 或 MRI 掃描圖像,手工繪制、注釋和修正他們關(guān)注的器官或異常情況。然后對(duì)特定的器官或異常情況的所有 3D 圖像切片重復(fù)這一步驟。
NVIDIA 的 AI 輔助注釋 SDK 能夠以 10 倍的速度大大加快此過程,并有助于更快地發(fā)現(xiàn)異常情況。這是通過使應(yīng)用程序開發(fā)者和數(shù)據(jù)科學(xué)家將 AI 輔助注釋 SDK 集成至他們現(xiàn)有的應(yīng)用程序中,將 AI 輔助工作流程用于放射線照相來實(shí)現(xiàn)的。
AI 輔助注釋 SDK 利用 NVIDIA 的遷移學(xué)習(xí)工具包不斷自我學(xué)習(xí),所以每個(gè)添加注釋的新圖像都可以用作訓(xùn)練數(shù)據(jù),進(jìn)一步提高所提供的預(yù)訓(xùn)練深度學(xué)習(xí)模型的精確度。
“我們可以獲得 NVIDIA 的 AI 輔助注釋技術(shù),并在幾天的時(shí)間內(nèi)將其集成至我們的圖像瀏覽器,”MGH & BWH Center for Clinical Data Science 的執(zhí)行董事 Mark Michalski 說。“我們目前需要注釋大量的圖像 – 有時(shí)一天大約一千張或更多,所以任何有助于自動(dòng)執(zhí)行此過程的技術(shù)都可能極大地減少注釋時(shí)間和成本。我們非常激動(dòng)可以利用 AI 輔助工作流程并與 NVIDIA 共同解決這些至關(guān)重要的醫(yī)學(xué)影像問題?!?/p>
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“整個(gè)放射科都需要參與進(jìn)來,從而在研究和臨床環(huán)境下成功地實(shí)施 AI,”NVIDIA 醫(yī)療保健部門主管 Abdul Hamid Halabi 說。“這款注釋 SDK 可以使放射科在其現(xiàn)有的工作流程中輕松釋放數(shù)據(jù)的價(jià)值。利用遷移學(xué)習(xí)工具包,放射科醫(yī)生可以對(duì)現(xiàn)有的所有 AI 應(yīng)用程序進(jìn)行調(diào)整,使之適合自己的病人。”