《電子技術(shù)應(yīng)用》
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信息技術(shù)跑出加速度

2020-03-23
來源:電子信息產(chǎn)業(yè)網(wǎng)

    如果我們將大數(shù)據(jù)、人工智能算法、算力運(yùn)用到藥理毒理研究、蛋白篩選、新藥研發(fā)中,就能夠大幅加快老藥新指征與疫苗的研制進(jìn)程。例如,在2015 年抗擊埃博拉病毒的新藥研制中,Atomwise公司準(zhǔn)備了埃博拉病毒入侵生物細(xì)胞的“爪”的模型,利用類似人腦神經(jīng)的網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行藥物成分分析,檢測(cè)已知的7000種可對(duì)抗這種“爪”的藥物,用不到一天的時(shí)間就在7000種藥物中成功找到能控制埃博拉病毒的兩種候選藥物,且成本不超過 1000 美元。如果利用傳統(tǒng)的方法進(jìn)行分析篩選,需要數(shù)月甚至是數(shù)年。

    新冠肺炎可能成為百年不遇的大流行病,其傳播速度和嚴(yán)重程度與1918年的流感疫情不相上下。全球需要加快針對(duì)新冠肺炎的療法研究和疫苗開發(fā)工作。目前利用已通過安全性測(cè)試的化合物庫和新的篩選技術(shù)(包括機(jī)器學(xué)習(xí)),科學(xué)家們能夠在幾周內(nèi)篩選出可用于大規(guī)模臨床試驗(yàn)的抗病毒藥物,從而加快藥物研發(fā)進(jìn)程。日前,英特爾、聯(lián)想以及華大基因宣布,三家公司正攜手加快新型冠狀病毒的基因組特性分析。利用聯(lián)想超算技術(shù)和基因組分析工具,可為全基因組測(cè)序和全外顯子測(cè)序的計(jì)算提供高達(dá)40倍的加速,幫助華大基因高效處理數(shù)據(jù),更快地生成可靠的基因組分析成果,從而縮短科研和臨床觀察的時(shí)間。

    

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    在基因測(cè)序工作中,每毫升體液通常會(huì)包含數(shù)百萬個(gè)不同的病毒體,而每個(gè)病毒體的基因組則包含大約30000個(gè)DNA堿基或字母。華大基因正在對(duì)許多感染患者和疑似感染患者的微生物進(jìn)行基因測(cè)序,而這些研究工作將會(huì)生成TB級(jí)乃至PB級(jí)的海量數(shù)據(jù)。要想高效快速地處理這些重要數(shù)據(jù),就需要采用更為先進(jìn)的高性能計(jì)算(HPC)基礎(chǔ)架構(gòu)、計(jì)算技術(shù)以及優(yōu)化的基因組分析方法。

    尋找疫苗和救治方法,在這場(chǎng)科學(xué)與病毒的賽跑中,目前許多的信息技術(shù)公司正與不同的科學(xué)家團(tuán)隊(duì)展開合作,為他們的研發(fā)提供算力、算法工具,助其快馬加鞭。例如,阿里云提供超大規(guī)模計(jì)算力、人工智能算法等技術(shù),支持鐘南山院士團(tuán)隊(duì)的科研人員加快開展對(duì)新冠病毒的新藥研發(fā)、病毒基因測(cè)序、蛋白篩選等相關(guān)工作,縮短攻關(guān)周期。

    

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